Araştırmacılar, genomun üç boyutlu yapısı hakkında yeni veriler sağlıyor

24 Haziran 2013 Pazartesi. -Avustralya ve Amerika Birleşik Devletleri'nden bilim adamları, sonuçları dijital baskısında yayınladığı genomik ve genetik alanının karşı karşıya kaldığı en büyük zorluklardan biri olan genomun üç boyutlu yapısının anlaşılmasına yeni bilgiler sağlıyor ' Doğa Genetiği '.

Vücudumuzun her hücresinin çekirdeğinde yaklaşık üç metre DNA yakından katlanır, bu da bazı genlerin diğerleri hariç "eksprese edilmesine" veya aktive olmasına izin verir. Sydney'deki Garvan Tıbbi Araştırma Enstitüsü'nden Doktorlar Tim Mercer ve John Mattick ve Seattle'daki Washington Üniversitesi'nden Profesör John Stamatoyannopoulos, genomun 3D yapısını yüksek çözünürlükte analiz ettiler.
Genler, birincisi proteinleri kodlayan ve eksprese eden sekanslar ve son olarak ortamdaki kodlayıcı olmayan DNA uzanımları olan "eksonlar" ve "intronlardan" oluşur. Genler kopyalandıkça veya kopyalandıkça, RNA'daki DNA'dan intron sekansları kesilir veya "eklenir" ve geri kalan eksonlar, bir proteini kodlayan bir sekans oluşturmak için birlikte zincirlenir. Çarpık olan eksonlara bağlı olarak, aynı gen farklı proteinler üretebilir.
ENCODE projesinden büyük miktarda veri kullanılarak Dr. Tim Mercer ve meslektaşları genomun katlanmasını çıkardılar, bir gen içinde bile seçilen eksonların kolayca açığa çıktığını keşfettiler. "Uzun ve son derece karmaşık bir asma düşünün, kolayca sökülebilen bazı üzümler sunan bükülmüş dalları, diğerlerini erişimlerinin ötesinde saklayın." Mercer.
"Aynı zamanda, üzümleri parmaklarınızın ucunda topladığınız tembel bir meyve seçici hayal edin - ekliyor -. Aynı prensip genom için de geçerlidir. Belirli genler ve hatta belirli eksonlar katlanmaya elverişlidir." Bu anlamda, bu araştırmacı, bilim adamlarının son yıllarda genom katlanmasının nasıl ifade edildiğini ve düzenlendiğini belirlemeye nasıl yardımcı olduğunu takdir etmeye başladığını belirtiyor.
"Bu çalışma, genomun üç boyutlu yapısının genlerin birleşmesini etkileyebileceğine dair ilk belirtiyi sağlıyor. Genomun, bir genin transkripsiyonunu başlatan sekans, promotör bölgesi olacak şekilde katlandığı sonucunu çıkarabiliriz. ekzonların yanında bulundu ve hepsi transkripsiyon makinesine götürüldü "diye vurguluyor.
"Bu, genomun transkripsiyon makinesinin etrafında, tersi yönde büküldüğü şeylere bakmanın yeni bir yolunu desteklemektedir. Transkripsiyon makinesiyle temas eden genler kopyalanırken, uzaktaki yörüngede kalan parçalar yok sayılırlar. "
Kaynak: www.DiarioSalud.net